בהיותו בירושלים לרגל חג הפסח של שנת 30 לספירה עושה ישוע אותות,‏ או נסים,‏ יוצאים מגדר הרגיל.‏ כתוצאה מכך רבים מאמינים בו.‏ נקדימון,‏ פרוש וחבר בסנהדרין (‏בית הדין העליון היהודי)‏,‏ מתרשם מישוע.‏ הוא רוצה לדעת יותר ולכן מבקר את ישוע לאחר רדת החשיכה;‏ ככל הנראה הוא עושה כן מחשש ששמו הטוב ייפגע בקרב המנהיגים היהודים האחרים אם מישהו יראה אותו.‏

‏”‏רבי”‏,‏ אומר נקדימון,‏ ”‏אנחנו יודעים שבאת מאת אלוהים להיות מורה;‏ שכן איש אינו יכול לחולל את הנסים שאתה עושה אלא אם כן אלוהים אתו”‏.‏ בתגובה אומר ישוע לנקדימון שכדי להיכנס למלכות אלוהים על האדם ’‏להיוולד מחדש’‏ (‏יוחנן ג׳:‏2,‏ 3‏)‏.‏

אבל כיצד יכול אדם להיוולד מחדש?‏ ”‏האם יוכל להיכנס שנית לרחם אמו ולהיוולד?‏”‏,‏ שואל נקדימון (‏יוחנן ג׳:‏4‏)‏.‏

לא,‏ אין זו משמעותן של המילים ’‏להיוולד מחדש’‏.‏ ישוע מסביר:‏ ”‏מי שלא ייוולד מן המים ומן הרוח לא יוכל להיכנס למלכות אלוהים”‏ (‏יוחנן ג׳:‏5‏)‏.‏ אם כן,‏ כאשר נטבל ישוע ורוח הקודש ירדה ונחה עליו הוא נטבל ”‏מן המים ומן הרוח”‏.‏ באותה עת נשמעה הכרזה מן השמיים:‏ ”‏זה בני אהובי,‏ ורצוי הוא בעיניי”‏ (‏מתי ג׳:‏16,‏ 17‏)‏.‏ כך הכריז אלוהים שהוא הוליד את ישוע כבן רוחני עם התוחלת להיכנס למלכות השמיים.‏ מאוחר יותר,‏ בחג השבועות 33 לספירה,‏ תישפך רוח הקודש על אחרים שנטבלו,‏ וכך יוולדו גם הם מחדש כבני אלוהים ילודי הרוח (‏מעשי השליחים ב׳:‏1–4‏)‏.‏

נקדימון מתקשה להבין את מה שמלמד אותו ישוע על המלכות.‏ לכן ישוע מספק לו מידע נוסף לגבי תפקידו המיוחד בתור בנו האנושי של אלוהים.‏ ישוע אומר:‏ ”‏כפי שהנחש הורם על־ידי משה במדבר,‏ כך צריך שיוּרם בן האדם,‏ כדי שכל המאמין בו יקבל חיי עולם”‏ (‏יוחנן ג׳:‏14,‏ 15‏)‏.‏

שנים רבות קודם לכן הוכשו בני ישראל על־ידי נחשים ארסיים והיה עליהם להביט בנחש הנחושת כדי להינצל (‏במדבר כ״א:‏9‏)‏.‏ בדומה לכך כל בני האדם צריכים לגלות אמונה בבן אלוהים כדי להינצל ממצבם המוביל למוות ולרשת חיי עולם.‏ ישוע מדגיש כיצד מתבטאת בכך אהבת אלוהים ואומר לנקדימון:‏ ”‏כה אהב אלוהים את העולם עד כי נתן את בנו יחידו,‏ למען לא יאבד כל המגלה אמונה בו,‏ אלא ינחל חיי עולם”‏ (‏יוחנן ג׳:‏16‏)‏.‏ לפיכך כאן בירושלים,‏ כשישה חודשים לאחר תחילת שירותו,‏ מבהיר ישוע שהוא הדרך לישועת האנושות.‏

ישוע אומר לנקדימון:‏ ”‏אלוהים שלח את בנו אל העולם לא כדי לשפוט את העולם”‏.‏ משמע הדבר שהוא נשלח לא כדי לשפוט את העולם לכף חובה ולגזור השמדה על כל בני האדם.‏ תחת זאת אומר ישוע שהוא נשלח ”‏כדי שהעולם ייוושע באמצעותו”‏ (‏יוחנן ג׳:‏17‏)‏.‏

מתוך פחד בא נקדימון לישוע בחסות החשיכה.‏ לכן מעניין שישוע חותם את השיחה ביניהם במילים:‏ ”‏זהו הבסיס למשפט:‏ האור [‏כלומר,‏ ישוע,‏ אשר משקף את האור באורח חייו ובתורתו]‏ בא אל העולם;‏ אך בני האדם אהבו את החושך ולא את האור,‏ שכן מעשיהם היו רעים.‏ העושה מעשים נתעבים שונא את האור ואינו בא אל האור,‏ פן ייחשפו מעשיו.‏ אך העושה את הטוב והישר בא אל האור כדי שיתגלה שמעשיו רצויים בעיני אלוהים”‏ (‏יוחנן ג׳:‏19–21‏)‏.‏

כעת אותו פרוש ומורה בישראל,‏ נקדימון,‏ יצטרך לחשוב על מה שזה עתה שמע לגבי תפקידו של ישוע במטרת אלוהים.‏